Простийпошук |
Розширенийпошук |
Покажчики
|
Професійний пошук |
Рубрикатор НБУВ |
Розподілений пошук |
Бази даних
Наукова періодика України - результати пошуку
Книжкові видання та компакт-дискиЖурнали та продовжувані виданняАвтореферати дисертаційРеферативна база данихНаукова періодика УкраїниТематичний навігаторАвторитетний файл імен осіб
 |
Для швидкої роботи та реалізації всіх функціональних можливостей пошукової системи використовуйте браузер "Mozilla Firefox" |
|
|
Повнотекстовий пошук
| Знайдено в інших БД: | Реферативна база даних (4) |
Список видань за алфавітом назв: Авторський покажчик Покажчик назв публікацій  |
Пошуковий запит: (<.>A=Tanin V$<.>) | |||
|
Загальна кількість знайдених документів : 3 Представлено документи з 1 до 3 |
|||
| 1. | 
Tanchuk V. Yu. Analysis of conformational flexibility of loop 110-120 of protein tyrosine phosphatase 1B [Електронний ресурс] / V. Yu. Tanchuk, V. O. Tanin, A. I. Vovk // Український біохімічний журнал. - 2013. - Т. 85, № 5. - С. 73-80. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BioChem_2013_85_5_10 Конформації каталітичного центру протеїнтирозинфосфатази 1B (PTP1B) та оточуючих петель відіграють важливу роль у каталізі й інгібуванні ензиму. 98 конформацій з 88 PDB файлів, які представлено PTP1B із різними лігандами, проаналізовано з метою дослідження особливостей рухливості петлі 110 - 120 та її окремих залишків. Відмінності виявлено за допомогою спеціального програмного забезпечення, яке проводить багаторазове порівняння обраних частин PDB файлів. Конформації розподілено на 6 кластерів. Виявлено, що петля, яка сформована залишками 110 - 120, може бути охарактеризована чотирма основними положеннями. Вона характеризується, переважно, основною конформацією і зберігає її під час руху WPD петлі. Три інші конформації є стабільними у разі закритої WPD петлі та, ймовірно, є вірогіднішими для РТР1В із субодиничною структурою. | ||
| 2. | 
Tanin V. Docking studies of typical conformations of protein tyrosine phosphatase 1B [Електронний ресурс] / V. Tanin, V. Tanchuk // Proсeedings of the National Aviation University. - 2014. - № 3. - С. 87-92. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/Vnau_2014_3_16 За допомогою докінгу відомих інгібіторів досліджено типові конформації протеїнтирозинфосфатази 1B. Найкращої конформації не виявлено, хоча для кожного інгібітора існує найбільш відповідна конформація. | ||
| 3. | 
Tanchuk V. Yu. Testing of a new docking scoring function on the example of inhibitors of protein tyrosine phosphatase 1B [Електронний ресурс] / V. Yu. Tanchuk, V. O. Tanin // Журнал органічної та фармацевтичної хімії. - 2015. - Т. 13, вип. 4. - С. 16-19. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/jofkh_2015_13_4_6 Нова нещодавно розроблена оціночна функція H1 для молекулярного докінгу тестувалася на комплексах протеїнотирозинфосфатази 1В (PTP1B) з банку даних PDB і за допомогою докінгу набору інгібіторів з бази даних NIH. Функція базується на оціночних функціях AutoDock і AutoDock Vina і реалізована в модифікованій версії AutoDock. Функція показала себе добре як у випадку комплексів з банку даних PDB, так і в реальному докінгу. Розрахунок pKi для комплексів з банку даних PDB виявився дуже точним. Молекулярний докінг проводився модифікованою версією AutoDock, яка використовує просторові обмеження і новий спосіб пошуку. Енергії комплексів мінімізувались, і pKi для одержаних комплексів оцінювались за допомогою нової функції H1. Як було показано раніше, конформації PTP1B в комплексах з лігандами поділяються на 5 груп. Всі 5 типових конформацій зв'язувальної кишені PTP1B використано для докінгу. Найкращі результати одержані при докінгу на кластерах з відкритою петлею WPD, хоча деякі сполуки не здатні утворювати достатньо добрі комплекси з ферментом у таких конформаціях. Функція показала високий "оціночний потенціал" (тобто здатність прогнозувати значення pKi) і "скринінговий потенціал" (здатність збагачувати верхні 10 або 20 % від прогнозування реально активними сполуками). Таким чином, оціночна функція H1 виявилась придатною для віртуального скринінгу потенційних інгібіторів PTP1B. Результати нової оціночної функції H1 були набагато кращими, ніж у вихідної оціночної функції AutoDock, яка була випробувана раніше. | ||
Попередній перегляд: 
Реферативна БД
 |
| Відділ наукової організації електронних інформаційних ресурсів |
 Пам`ятка користувача |